根腐病
7-8月高温多雨,荆芥植株易发生真菌感染，感染后地上部迅速萎蔫，根、根茎变黑、腐烂。
防治方法：注意排水，播前新高脂膜处理种子；发病初期用根施通灌根。
立枯病
多发生在5-6月，低温多雨、土壤潮湿时易发病，发病初期苗茎部发生水渍状小黑点，小黑点扩大后呈褐色，茎基部变细，倒伏枯死。
防治方法：选用良种，加强田间管理，做好排水工作；遇低温多雨天气，喷新高脂膜，10天喷1次，连喷2-3次；发病初期针对性药剂防治。
茎枯病
茎枯病危害叶、茎、花穗，叶片感病后，似开水烫伤状，叶柄为水渍状病斑；茎部染病后，出现水渍状褐色病斑，后扩展成绕茎枯斑，造成上部茎叶萎焉；花穗染病后，呈黄色，不能开花。
防治方法：在发病初期，针对性药剂与新高脂膜喷施，提高药效。每隔7天1次，连喷3次。
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